有机肥是主要来源于植物或动物，其中含有大量有机物质，能提供给农作物多种无机和有机养分，不仅能为农作物提供全面营养，而且肥效比较长，可增加和更新土壤有机质. 生物肥能促进土壤微生物繁殖，起到培肥改良土壤的作用。
化肥一般多是无机化合物，用化学或物理方法制成的含有一种或几种农作物生长需要的营养元素的肥料。化肥的养分比较单纯但含量高，通常土壤中的营养元素不能够满足农作物生长的时候，就会使用含有某些成分的化肥来补充养分，化肥的肥效快，费劲比较猛。
有机肥和化肥各有特点：
（l）有机肥料含有大量的有机质，具有明显的改土培肥作用；化学肥料只能提供作物无机养分，长期施用会对土壤造成不良影响，使土壤“越种越馋”。
（2）有机肥料含有多种养分，所含养分全面平衡；而化肥所含养分种类单一，长期施用容易造成土壤和食品中的养分不平衡。
（3）有机肥料养分含量低，需要大量施用，而化学肥料养分含量高，施用量少。
（4）有机肥料肥效时间长；化学肥料肥效期短而猛，容易造成养分流失，污染环境。
（5）有机肥料来源于自然，肥料中没有任何化学合成物质，长期施用可以改善农产品品质；化学肥料属纯化学合成物质，施用不当能降低农产品品质。
（6）有机肥料在生产加工过程中，只要经过充分的腐熟处理，施用后便可提高作物的抗旱、抗病、抗虫能力，减少农药的使用量；长期施用化肥，由于降低了植物的免疫力，往往需要大量的化学农药维持作物生长，容易造成食品中有害物质增加。
（7）有机肥料中含有大量的有益微生物，可以促进土壤中的生物转化过程，有利于土壤肥力的不断提高；长期大量施用化学肥料可抑制土壤微生物的活动，导致土壤的自动调节能力下降。